潔凈室的建筑布局和凈化空調系統有密切關系，凈化空調系統既要服從建筑總體布局，建筑布局也要符合凈化空調系統的原則，才能充分發揮相關功能的作用。凈化空調的設計者不僅要了解建筑布局以考慮系統的布置，而且要給建筑布局提出要求，使其符合潔凈室原理。
潔凈室的平面布局
潔凈室一般包括潔凈區、準潔凈區和輔助區三部分。
潔凈室的平面布置可以有以下幾種方式：
外廊環繞式：外廊可以有窗和無窗，兼作參觀和放置一些設備用，有的在外廊內設值班采暖。外窗必須是雙層密封窗。
內廊式：潔凈室設在外圍，而走廊設在內部，這種走廊的潔凈度級別一般都較高，甚至和潔凈室同級。
兩端式：潔凈區設在一邊，另一邊設準潔凈和輔助用房。
核心式：為了節約用地、縮短管線，可以潔凈區為核心，上下左右被各種輔助用房和隱蔽管道的空間包圍起來，這種方式避開室外氣候對潔凈區的影響，減少了冷熱能耗，利于節能。
潔凈室建筑裝飾的重要性主要表現在以下兩個方面：
（1）對綜合性能的影響：潔凈室要求材料不產塵，結構不積塵，密封嚴密不透塵。所以潔凈室的裝飾會直接潔凈效果。
（2）對于造價的影響到：潔凈室與一般辦公樓相比，是高造價的建筑物。
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